Protein–RNA interactions for Protein: Q9D443

4933415A04Rik, RIKEN cDNA 4933415A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933415A04RikQ9D443 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
4933415A04RikQ9D443 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
4933415A04RikQ9D443 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms