Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms