Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph14Q9D3W1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms