Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed11Q9D2R4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed11Q9D2R4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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