Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fndc8Q9D2H8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms