Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pramef12Q9D2F1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms