Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SarnpQ9D1J3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SarnpQ9D1J3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms