Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MrnipQ9D1F5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MrnipQ9D1F5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms