Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Susd3Q9D176 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Susd3Q9D176 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms