Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Pbdc1Q9D0B6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbdc1Q9D0B6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms