Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SdhdQ9CXV1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SdhdQ9CXV1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SdhdQ9CXV1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms