Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Exo5Q9CXP9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Exo5Q9CXP9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Exo5Q9CXP9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Exo5Q9CXP9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Exo5Q9CXP9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms