Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sugt1Q9CX34 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sugt1Q9CX34 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms