Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RpainQ9CWY9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RpainQ9CWY9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms