Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pin4Q9CWW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms