Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms