Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Snx10Q9CWT3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx10Q9CWT3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms