Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NubplQ9CWD8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NubplQ9CWD8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms