Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms