Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rhobtb3Q9CTN4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms