Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NmbQ9CR53 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NmbQ9CR53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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