Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ykt6Q9CQW1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms