Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tmed6Q9CQG0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmed6Q9CQG0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms