Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc5Q9CQA1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc5Q9CQA1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms