Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Commd4Q9CQ02 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Commd4Q9CQ02 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms