Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlhe41Q99PV5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms