Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim12aQ99PQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim12aQ99PQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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