Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim26Q99PN3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim26Q99PN3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim26Q99PN3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms