Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GpnmbQ99P91 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GpnmbQ99P91 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms