Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtn4Q99P72 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rtn4Q99P72 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms