Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NsmfQ99NF2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NsmfQ99NF2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms