Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gdpd3Q99LY2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms