Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nus1Q99LJ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nus1Q99LJ8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms