Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cstf3Q99LI7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cstf3Q99LI7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms