Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Sh3bp5lQ99LH9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Sh3bp5lQ99LH9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Sh3bp5lQ99LH9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Sh3bp5lQ99LH9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Sh3bp5lQ99LH9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Sh3bp5lQ99LH9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Sh3bp5lQ99LH9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
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Sh3bp5lQ99LH9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sh3bp5lQ99LH9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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