Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pagr1aQ99L02 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms