Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prpf19Q99KP6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms