Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ciao1Q99KN2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ciao1Q99KN2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms