Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ufsp2Q99K23 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms