Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlgn1Q99K10 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms