Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Def8Q99J78 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms