Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CsprsQ99388 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CsprsQ99388 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms