Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nrif1Q923B3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nrif1Q923B3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms