Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Med28Q920D3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Med28Q920D3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms