Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Snx4Q91YJ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx4Q91YJ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms