Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atl3Q91YH5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atl3Q91YH5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atl3Q91YH5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms