Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm2Q91YD4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm2Q91YD4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms