Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tdrd3Q91W18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tdrd3Q91W18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms