Protein–RNA interactions for Protein: Q91V01

Lpcat3, Lysophospholipid acyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat3Q91V01 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lpcat3Q91V01 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lpcat3Q91V01 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms