Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms